无菌条件是植物组织培养成功的关键因素。接种室应保持清洁和无菌，因此墙壁、地板和天花板应光滑无缝，以避免灰尘和微生物的积累。窗户应用双层玻璃密封，防止昆虫、灰尘和微生物进入。大型组织培养室通常在接种室的入口处设有风淋室。小型和微型组织培养室可设计为不带风淋室的制剂室。在进入灭菌接种室之前，应进行必要的清洁。接种室应配备空调装置，通风主要依靠空调，或安装空气净化器。为减少室内细菌数量，大中型组织培养室在接种室(及制剂室)设置臭氧机，每天进行灭菌消毒;如果资金紧张，至少需要安装紫外线灯进行照射杀菌。
接种室要求配备单人或双人超净工作台，接种用酒精燃烧器、各种医用镊子、剪刀、手术刀、接种针、过滤灭菌器、存放70%、95%酒精或酒精棉球的罐、试管架、台、台车(用于放置、运输培养瓶)以及上述臭氧机、空气净化器等工具。超净工作台需要定期清洗过滤膜。
